正确采集标本、运送标本，选择适当的培养基和培养技术，对细菌学的诊断是至关重要的。
1.检验单需填写清楚，尤其是标本种类、检验目的及临床诊断。
2.采集血液、脑脊液或穿刺液时，应严格遵守无菌操作，防止杂菌污染。采集粪便、肛拭等标本虽不需无菌操作，但应尽可能避免杂菌混入。
3.应在病人服用抗菌药物之前采集标本，标本应及时运送到微生物组细菌室或临时冷藏保存。注意某些标本（脑膜炎和淋病奈瑟氏菌）送检时则需保温。
4.细菌标本的采集及运送必须注意安全，防止污染环境及传播疾病。
5.各种具体检验要求见下表：
项目，仪器和方法，生物参考区间，临床意义，干扰因素
痰，VITEK2COMPACT全自动细菌鉴定仪CO2培养箱，不适用，病原菌的分离及鉴定，协助临床诊断，供临床用药参考：抗菌药物、温度
尿液，VITEK2COMPACT全自动细菌鉴定仪CO2培养箱，不适用，病原菌的分离及鉴定，协助临床诊断，供临床用药参考：抗菌药物、温度、无菌操作
粪便，VITEK2COMPACT全自动细菌鉴定仪CO2培养箱，不适用，病原菌的分离及鉴定，协助临床诊断，供临床用药参考：抗菌药物、温度
穿刺液及肺泡灌洗液，VITEK2COMPACT全自动细菌鉴定仪CO2培养箱，不适用，病原菌的分离及鉴定，协助临床诊断，供临床用药参考：抗菌药物、温度、无菌操作
各种分泌物及导管尖端，VITEK2COMPACT全自动细菌鉴定仪CO2培养箱，不适用，病原菌的分离及鉴定，协助临床诊断，供临床用药参考：抗菌药物、温度、无菌操作
生殖道标本，VITEK2COMPACT全自动细菌鉴定仪CO2培养箱，不适用，病原菌的分离及鉴定，协助临床诊断，供临床用药参考：抗菌药物、温度、无菌操作
成人、儿童血培养；骨髓培养及鉴定，BacTALERT3D240血培养仪VITEK2COMPACT全自动细菌检定仪CO2培养箱，无细菌生长，对菌血症和败血症的诊治具有十分重要的意义：抗菌药物、无菌操作、温度
无菌体液培养及鉴定，BacTALERT3D240血培养仪VITEK2COMPACT全自动细菌鉴定仪CO2培养箱，无细菌生长，在感染情况下，只要检出细菌，通常都视为病原菌，抗菌药物、温度、无菌操作
脑脊液培养基及鉴定，BacTALERT3D240血培养仪VITEK2COMPACT全自动细菌鉴定仪CO2培养箱，无细菌生长，化脓性脑膜炎可由多种细菌引起，除脑膜炎双球菌外，尚有肺炎双球菌等：抗菌药物、温度、无菌操作
淋球菌培养及鉴定，VITEK2COMPACT全自动细菌鉴定仪CO2培养箱，未检出淋病奈瑟菌，淋病的金标试验，阳性：淋病患者，抗菌药物、温度
支原体培养及药敏，CO2培养箱手工方法，阴性，协助临床诊断，供临床用药参考：抗菌药物、温度
衣原体培养，手工方法，阴性，阳性：非淋菌性尿道炎或健康携带者，抗菌药物、温度
