这个时期，周恩来同志积极推动黄炎培等三党三派（即农工民主党、国家社会党、中国青年党，职业教育社派、救国会派和乡建派）的领导人成立"统一建国同志社"，以坚持团结，反对分裂；坚持抗战，反对投降；坚持进步，反对倒退。"同志会"的首脑就是黄炎培。从此，中共和民主党派开始了并肩战斗的历程。
第一次反共高潮被打退以后，山城重庆上空的乌云又一阵阵浓密起来，充满了一股"山雨欲来风满楼"的肃杀之气，群众中有一种惶惶不安的情绪。在这样的气候里，黄炎培竟毫不避讳地邀请周恩来到中华职业教育社主办的"星期讲座"作公开演讲。海报一贴出，整个山城都沸腾起来了，原定的能容纳千把人的大会场，很早就被蜂拥而来的青年群众挤得水泄不通了，而还有一批又一批人正不断涌来。当黄炎培陪伴周恩来来到时，看到这种情景，既高兴又发愁会场挤不下。他俩商量了一下，当即决定把讲演场所移到张家花园巴蜀学校的操场上。周恩来就站在方凳上讲话，三四千群众围在他四周静听，连篮球架上、树上和广场以外的山坡上，都挤满了人群。周恩来整整讲了3小时，除了不时爆发出如雷的掌声之外，会场始终非常安静，也没有人随便走动。
皖南事变后，黄炎培立刻前往曾家岩50号，向周恩来和中共朋友致深切的慰问。他明确表示："不论事情经过之是非，当局如此措施，绝对错误！"他向周恩来表示："如果参政会讨论反共问题，我们不能奉陪。"那些天，黄炎培每天都和周恩来联系，听取中共中央的对策，为此而度过好几个不眠之夜，常常一直等过夜半，就在电话机旁守候周恩来的电话。
尽管蒋介石派出宋美龄、张群等人，百般拉拢民主党派人士，企图孤立中共，各个击破，但爱国的民主人士，却在暴风骤雨中和中共同舟共济，并肩战斗，更加团结了。他们在周恩来和南方局的积极协助下，以"统一建国同志会"为基础的三党三派，在重庆正式成立了中国民主政团同盟，黄炎培当选为第一任主席。
1945年1月23日，毛泽东电告周恩来即往重庆与国民党谈判。24日，周恩来飞抵重庆。他在机场发表谈话说："此次来渝，是在国民党、民盟提议召开党派会议作为国是会议的预备会议，以便正式商讨国是会议和联合政府的组织及其实现的步骤。"25日，周恩来立即邀集黄炎培、冷、沈钧儒、郭沫若等民主人士，在曾家岩50号商谈召集党派会议等问题。周恩来分析了当前形势，传达了中共中央对党派会议的意见。黄炎培在这天的日记上写道："午后，偕御秋（冷）应周恩来之邀，至曾家岩50号听取报告，恩来甫从延安来。同座有左舜生、沈衡山、章伯钧、张申府、邓初民、郭沫若、徐冰、王若飞。"2月8日日记上又记道："国共问题，雪艇（王世杰字）、恩来二人迭次谈判，实有眉目，而不愿宣布。余为联："不求甚解，乐观厥成"。"黄炎培喜悦的心情溢于言表。
在此期间，作为第三方面人士，黄炎培参与起草有关停火的条件，其中关于东北驻军的建议是莫德惠起草的。1946年10月28日，此文件用复写纸誊写两份，分别送到国民党与共产党参阅。下午4时，梁漱溟赶到黄炎培家，说："恩来接阅后大大生气，认为有关东北两点建议不得了，顿足而哭，说要死掉多少老百姓啊！"黄老一听就急了，即刻拉上李璜、罗隆基、莫德惠赶到国民党党部。当时，孙科等国民党要人正在传阅此件。黄老急中生智，旁若无人，上前对孙科说："文稿有错别字，须加改正。"一把抓过来，扭头就走。孙科等人莫名其妙，忙问："错在哪里？"此时，黄炎培已出大门，杨长而去。他重新召集大家，把周恩来同志指出的有关东北两条建议删去，此事才避免引起恶果。
国共谈判陷入停顿后，黄炎培愁肠百结，切望对国共谈判能做出推动工作。于是，他邀褚辅成、冷、左舜生、章伯钧、王云五、傅斯年等6位国民参政员，宴请王若飞（其时，周恩来回延安）和王世杰、邵力子，要求把他们希望国共继续会谈的意见转达给中共中央和蒋介石。随后，他们又给延安发了电报。电文如下：
延安毛泽东、周恩来先生惠鉴：
团结问题之政治解决，久为国人所渴望。自商谈停顿，参政会同仁深为集急。目前经辅成等一度集商，一致希望继续商谈。先请王若飞先生电闻，计达左右。兹鉴于国际国内一般情势，惟有从速恢复商谈，促成团结，不惟抗战得获早胜，建国新猷亦基于此。敬掬公意，伫候明教。褚辅成、黄炎培、冷、王云五、傅斯年、章伯钧。
不几天，他们就接到了中共中央的复电。电文如下：
……倘因人民渴望团结，诸公热心呼吁，促使当局醒悟，放弃一党专政，召开党派会议，商组联合政府，并立即实行最迫切的民主改革，则敝党无不乐于商谈。诸公专临延安赐教，不胜欢迎之至，何日启程，乞先电示。扫榻以待，不尽欲言。
对于共产党的邀请，黄老很高兴，他很想到延安去看看。
在黄炎培的积极推动下，他和冷、褚辅成、章伯钧、傅斯年、左舜生等六位国民参政员，终于1945年7月1日飞往他向往已久的延安。毛泽东、周恩来、朱德、刘少奇等中共领导人在机场欢迎了他们，并在当天晚上举行了盛大的欢迎晚会。周恩来致欢迎词，黄炎培代表6人致答词。他和周恩来在延安见面，感到无比的高兴和亲切。
黄炎培一行6人，在延安访问了5天，天天和毛泽东、周恩来见面晤谈，并共同商定两点：一、国民大会停止进行；二、从速召开政治会议。关于政治会议的组织、性质、议程等等，同意由中共提出，并请中共整理成一个会议纪要。
5天中，黄炎培与中共中央领导人全都见面会晤了，还会晤了许多熟朋友，已经留连忘返了。他用一句话来形容他在延安的感受：如坐春风之中。欢聚是那样地短暂！回到重庆，他立即撰写了《延安归来》一书，如实地报道了中国共产党在解放区推行的政策和军事、政治、经济上的辉煌成绩，以及人民朴实、自由和健康欢乐的生活。陈毅同志曾热情地对黄炎培说："那个艰难的年代，能为共产党人说话的，空谷足音，能有几人！"
从那以后，在促进国共和谈，在反对国民党发动内战，在政治协商会议中，黄炎培和周恩来的往来更密切了，和共产党的合作更默契了。
政治协商会议在中共和民主人士千辛万苦的共同努力下，终于达成了五项协议。那原本是为各方面接受的一个较为民主的建国纲领。但是，立刻又被国民党当权派破坏了，在他们制造了较场口血案以后，内战的烽火又重新燃起。
悲天悯人的黄炎培，又不顾70岁高龄，颠颠踬踬地为国共和谈奔走呼号。他无数次推心置腹地和周恩来长谈，无数次奔走在沪宁道上。但是，蒋介石和陈诚靠着美国军事力量的支持，正得意洋洋地叫嚣着"三个月消灭共产党"，"半年内消灭共产党"，对黄炎培的话他们怎能听得进呢！
1945年10月，国民党攻占了张家口，蒋介石被自欺欺人的"胜利"冲昏了头脑，不顾一切地宣布召开"国民大会"。中共宣布拒绝参加伪"国大"，民盟也接着宣布拒绝参加伪"国大"。周恩来对黄炎培等民主人士说：只要民盟不参加伪"国大"，蒋介石的"国大"开了就很臭了。黄炎培不爽与周恩来之约，尽管蒋介石派了十几名大员穿梭般前来苦劝黄炎培参加伪"国大"，都被黄炎培坚决拒绝了。当伪"国大"在南京开张演出时，周恩来特意在梅园新村邀请黄炎培和民盟领导人宴聚。他们亲切地畅叙战友情怀，并摄影留念。
但黄炎培的心情仍不乐观，他担心的是共产党能否在战场上取胜。在前几天他和周恩来的一次长谈时说："和谈的门是关死了，今后当然只有看前线了。但是，共产党打得嬴吗？"周恩来郑重地说："我们共产党是不要打的，国民党一定要打，共产党也只有打了，也只有好好打了。争取中国的和平与民主，我们共产党是有决心的；蒋介石逼着我们打，我们只好打。打不赢，我们不怨天，不尤人，只怪我们自己没有打好。不过，我们是有信心的。少则半载，多则一年，就能见分晓的。我关照上海的同志，以后随时把前线的消息向你报告。"这样，黄炎培也就放心地回上海了。
1948年5月1日，中国共产党发布五一劳动节口号，提出在解放区召开新政治协商会议，成立民主联合政府。其时，民盟已被国民党宣布为"非法组织"而强迫解散，黄炎培被列为国民党的黑名单的第一名。他在国民党特务严密监视下蛰居上海，以卖字为生。但他得知中共的号召后，立刻召集了民主建国会的常务理事会，决议宣布响应五一号召。随后，经过共产党的安排，他于1949年2月14日潜离上海，经香港转赴解放区，于3月25日抵达北平，下午就到机场欢迎毛泽东、周恩来、刘少奇等抵平。翌日晚，毛泽东在家里设宴招待黄炎培，周恩来作陪。他们又在已解放的北平聚首了，其欢乐的心情是可想而知的。自此以后，他们朝夕相见，共商国事。黄炎培的日记上频繁出现"与恩来长谈数小时"、"周恩来邀餐"的字样。在解放军渡江后，黄炎培立即向上海市民广播，告诉上海人民，中国人民解放军已逼近上海，劝上海同胞快起来作局部和平运动，迎接上海解放。他哪里知道，他的二儿子黄竞武在上海被国民党特务逮捕了。上海解放后，他收到的第一份电报，就是报告黄竞武已被活埋牺牲。黄竞武是中国民主同盟中央组织委员会委员、民主建国会临时干事会的常委干事，在重庆时曾担任周恩来与美国人会谈时的翻译。黄炎培得此噩耗，悲痛之极。周恩来立刻赶来给以亲切的慰问，陈毅、饶漱石、潘汉年、沙千里等也从上海发来唁电。
1949年9月21日，中国人民政治协商会议第一届全体会议在北平举行，黄炎培当选为中央人民政府委员。10月1日，在天安门城楼上与毛泽东等党和国家领导人一起宣告伟大的中华人民共和国成立。他心情澎湃，即兴赋咏《天安门》诗一首，共八节，有句曰："红场三十万众，赤旗象征赤心，赤心保卫祖国，赤心爱护人民。"这就是黄炎培庄严的誓言。
