作为一名中国封建史上为数不多的政治女性，慈禧不失聪明与干练，在危急时刻曾尽力维护国家利益，做出了虽不成功但在当时可称合理的反应。她曾经在1884年马尾海战爆发后向法国宣战。1894年她亦向日本宣战。1900年6月21日向八国联军宣战。她破除满汉界限，大力起用曾国藩、李鸿章、张之洞等名臣，开办洋务运动，造就所谓“同治中兴”气象；支持左宗棠收复新疆。执政后期，发布新政诏书，废除科举，兴办新式学堂，大量选派留学生，开始宪政改革等举措，是为人才方面的重要改革。破除满汉不通婚禁令，禁止妇女缠足。慈禧执政48年中，应该说是很勤政的，即使在病中也坚持处理政务。在她统治中国近半个世纪的时间里，一直牢牢地控制着国家的局面，掌握着最高统治权，国家没有出现地方割据的分裂局面。此外，她推动京剧艺术发展，建立北京动物园，都是不应被人遗忘的。
历史对她的负面评价远大于正面评价。慈禧太后素来以残忍狡诈和对权力的执着而闻名。先后起用湘军、淮军人物，是为了镇压太平天国，维护其统治目的，并非完全自愿破除满汉界限。在她执政的40多年中，以她为首的清政府签订了众多丧权辱国的不平等条约，如《马关条约》、《辛丑条约》等。1861年发动政变夺取政权，处死原来控制政权的八位大臣中的三位。1881年，毒死同有训政权的太后慈安（慈安的死是否是慈禧造成的历史上仍有争论）。1885年，在取得了对法的镇南关大捷后，仍然让清政府向法国屈膝求和，让中国“不败而败”，法国“不胜而胜”。1894年中日甲午战争爆发时，她正花费巨资，甚至不惜动用海军军费兴建北海公园用以庆祝自己的60大寿，并留有名言“谁让我不高兴一阵子，我就让他不高兴一辈子”（有多种版本）。1895年，她大兴土木，重新修建自己的陵墓，整个工程长达13年之久，直到她死前才完工，耗资巨大，使重修的慈禧陵成为清代最豪华独特的一座皇家陵寝，也为自己的陵寝乃至整个清东陵的被盗埋下了祸根。1898年，她彻底扼杀了戊戌变法，囚禁光绪。因为听信庆亲王等人编造的洋人要迫其退位的谣言，将义和团引入北京，失去控制，继而宣布向所有西方国家宣战，引发八国联军入侵的惨祸，中国的主权地位丧失殆尽，日本俄国自此可以在中国北方地区驻军，后患无穷。她杀害支持维新变法的光绪宠妃珍妃的行为，为世人所不齿。
