康熙帝驻跸呼和浩特期间，工作也是夜以继日，他致皇太子信中说：“此数日，自早至夜，分无有暇”。上述事宜在北京也可以办理，那么为什么动用众多人马，耗费巨额粮草，亲临塞外呢？其中有两个原因值得注意：一、呼和浩特不仅为塞外名城、交通枢纽，更重要的是它与噶尔丹的距离比北京近得多，所以康熙帝驻跸呼和浩特办理剿灭噶尔丹事宜实属方便，“朕来归化城者，一则巡阅地方且近厄鲁特降人，相机调度”；二、康熙帝率兵出塞，对噶尔丹属众能起到威慑作用。困境中的很多厄鲁特人无疑感到与其让清军前来剿灭，倒不如先去投附，他们纷纷前来投诚，与康熙帝出塞不无关系。
完成部署后，康熙帝离开呼和浩特前往鄂尔多斯，一边等待噶尔丹的消息，一边在土默特、鄂尔多斯地区打猎消遣。不久，康熙帝的军政措施出现反应，严密封锁使噶尔丹处境更加窘迫，属众对他失去信心，转而投奔清朝，清朝劝降之使纷之沓来，加剧了属众的奔逃。大寨桑土谢图诺尔布带领属下八十人投奔清朝，这在众寨桑中引起轩然大波，他是自昭莫多之战后准噶尔部投附清朝的最大人物。
此时，噶尔丹面临两大难题：一、属众奔逃不止，力量日益减弱；二、康熙随时直驱而来攻灭自己。于是他采取兼顾二者的应付办法，即诈降。通过诈降，一方面蒙骗属众，制止奔逃，以保存力量；另一方面欺骗清军，阻止前来，以求脱身之法。十月十二日，噶尔丹从驻地通齐尔，派遣寨桑格垒沽英出使清朝实施诈降。十一月十七日，使者一行来到边地后，费扬古派人送往康熙帝驻地。十一月二十五日，格垒沽英到达康熙帝在鄂尔多斯的行猎营地胡思泰，递交噶尔丹致康熙帝书。此书只简单回顾了准、清、藏、喀尔喀之间历史关系，对解决眼前清准关系没有提出任何具体建议。然格垒沽英同康熙帝的谈话内容却极为具体、生动。康熙帝致皇太后的信中详细描述自己与格垒沽英的谈话：
其言，土谢图诺尔布投附之后，噶尔丹已知自己败坏终结，召丹济拉等众寨桑议时，众言眼下俱知我等穷困异常，必败无疑，故我国为首寨桑屡屡逃亡内附，下边人等也无一日不往逃者。今若不往圣主投附，当往何处耶？若有地方收容养育我等而可图一事，我等将随汝而往，否则不相随也。噶尔丹无奈而遣我来。临行前，噶尔丹、丹济拉摒其左右而使我入内面谈。他言，我所行之事，由始有误，而致今日。尔到彼处，应视其大臣之情形，若其有养育我等形状，吾将前往投附矣。吾屡做使臣，故教之于彼等是否言语答对稍硬或稍谦等后，噶尔丹、丹济拉曰，吾等无投身之处，只求保全性命耳，如何能出微小不逊之词耶？尔将遵旨而行，勿出不逊之词。退出后，丹济拉单独嘱我曰，此次出使，关系我残留之微少厄鲁特之生死。尔将勉之慎之。又阿巴寨桑、车凌奔寨桑握手曰，速去速回，吾等侯尔消息，也将往寻圣主也。尔之妻子吾等予以关照。当问格垒沽英在彼何以为食？
言，在萨克萨图古里克等地野兽丰富，吾之众人若获得野兽，当食兽肉，野兽无获，杀马而食。现已鸟枪药尽而以捕兽器打牲。地苦寒，常有冻馁者。吾行时已到十月十二日，现当有许多死者矣。我们厄鲁特多难，生命不息，持至今日矣。言罢泪出。噶尔丹对众人言，天下之人不尽相同，太平皇帝乃不寻常之人，其恩惠居然达于敌国矣，我当携国人，一同前往归顺圣主。言罢叹息不止。观此情由，其归附之情非常真切。臣窃思，仰赖天恩，大业得以完成矣！
可见，噶尔丹精心策划的一场骗局，经格垒沽英精彩表演，居然初获成功，使康熙帝坚信噶尔丹欲降是真。作为使臣格垒沽英出色地完成了噶尔丹交给的使命，达到了欺骗康熙的目的。然而格垒沽英在鄂尔多斯受到康熙帝的亲切接见和细致关照，被康熙帝的热情和宽厚深深感染，投归了清朝，还表示愿意回去说服噶尔丹投归清朝。
清军前线统帅大将军费扬古则用敏锐的眼光识破了噶尔丹投降骗局。他于十一月二十六日，向康熙帝发来密折分析噶尔丹诈降之状曰：
噶尔丹原乃奸穵之人，见不能保护伊所余之数人，遣格垒沽英都喇勒等二十五人，以遣使为名，蛊惑伊之属下，暂且安抚人心。格垒沽英都喇勒等返回后，胡乱编造种种谎言，安定人心，以求脱身远遁隐匿，不可料定。既然如此，将噶尔丹所遣之格垒沽英都喇勒等带入，暂停遣返，使噶尔丹以下之厄鲁特人惊惶猜疑。并建议：“必精选马匹，交付干练之人，进剿噶尔丹。
然而，康熙帝不仅没有采纳费扬古的正确意见，反而压服费扬古，统一君臣意见，并于十二月二日（十二月二十五日），遣回格垒沽英，限噶尔丹七十天内亲自来降，否则“朕啮雪往讨，断不中止”。放弃进剿的康熙帝在格垒沽英起程后也踏上归途，于十二月二十日（一六九七年一月十二日）回到北京。康熙帝第二次亲征虽然没有达到消灭噶尔丹的目的，但一系列军政部署并没有因他回师而发生变化，清朝对噶尔丹的封锁依然严密；招降、瓦解措施日见成效。因此前来投诚之厄鲁特人络绎不绝，到康熙三十六年（一六九七年）二月中旬时，噶尔丹部众已逃散殆尽，其身边不足一千人，噶尔丹也丢弃佛像、经卷，仅率二十余骑逃脱。这一次，噶尔丹精锐丧失殆尽，集团也土崩瓦解，可谓危在旦夕。康熙帝要他归降，但噶尔丹不甘心失败，继续不断制造各种麻烦，于是就又有了康熙的第三次亲征。
康熙三十六年（一六九七年），康熙帝又带兵渡过黄河亲征到达克鲁伦河北岸的托诺山。在天山脚下的天山寺，还留下了一段流传千古的故事。
据说，康熙身上带着一份从来秘不示人的“皇舆全览图”，这是一份在当时世界上居第一流水平的军事地图，凭借这份地图，康熙运筹帷幄，百战百胜。但是尽管如此，遇上西北凶险的黄沙扑面的大风天气，康熙的北伐大军还是迷了路。天近黄昏，抚远大将军费扬古忽然发现，风沙渐渐平息，一座金碧辉煌的喇嘛寺奇迹般地立在前面山谷中。他决定请圣驾在寺中下榻，休息一夜，第二天一早再行军。康熙同意了费扬古的禀告，传旨命大军就地安营扎寨，自己四处巡查，待将士们立帐安营，支锅垒灶，吃罢了晚饭，才来到天山寺前。
这时，天色已晚，寺庙内外灯火通明，费扬古和一群迎驾的喇嘛，正规规矩矩地站在寺前恭候大驾的到来。领头的喇嘛手捧一条“浪翠”献给康熙。康熙谦和地接了过来，命侍卫取出一条丝带，还赠喇嘛，互换了祝福吉祥如意的哈达。并吩咐侍卫们说：“朕下榻寺庙，任何人不得入寺骚扰，更不得影响喇嘛敬佛诵经，违旨者，依法论处。”说罢，在费扬古将军的护卫下，步入寺庙。
天山寺寺内殿阁错落，正檐宇脊纵横，飞殿殿门大敞，里面可见一座巨大的镀金佛像，像前供品罗列，香烟缭绕。一个身披黄袈裟、手持禅杖的大喇嘛，立于殿前。见康熙到来，大喇嘛猛地抬起头来，斜视康熙，两眼射出可怕的凶光。直视了好一会儿，他才低眉垂首，向康熙施礼，将康熙带到西殿，自己告退走了。大喇嘛刚一退出西屋，费扬古就对康熙说：“万岁，我看那番僧不是什么好东西，他竟敢斜视万岁，国法难容，真想一刀砍了他！”康熙手轻轻一挥说：“万万不可鲁莽行事，边陲番僧，不识礼法，亦不得苛求！”费扬古“喳喳”应诺。
康熙盥洗用膳后，费扬古又随侍他去正殿拜佛。众喇嘛正分四列趺坐诵经，就在康熙拜佛时，费扬古发现有微尘从殿梁之上悠悠飘落，心中一惊。暗自向上窥视，却又不见有何动静。再看众喇嘛中，已没有那个傲慢的大喇嘛了。费扬古心知不正常，便抽身出殿，身子轻轻一纵，跳到正殿屋檐上。他伏身殿脊，借着星光，四下察看，见一黑影，从东配殿跃到万福堂的房顶上。费扬古哪敢怠慢，急忙跳下地去，溜着墙根儿，轻移脚步，紧紧跟到万福堂窗下。这时只听一声咳嗽，就见那个大喇嘛手挂念珠快速地走出了堂门，那堂上黑影也轻轻落下，两人一晃便不见了。
费扬古感到十分蹊跷，又轻轻溜回东配殿窗下，向里一看，不看则罢，一看吓了他一大跳，他发现那大喇嘛又到了东配殿中。正巧这时，传来一咚咚咚的脚步声，费扬古连忙闪过一边紧盯着里面的动静。原来是一个手端茶盘的小喇嘛走了过来，盘中放着两只杯子。小喇嘛把茶端进东配殿，放在大喇嘛面前的桌上，就听大喇嘛悄声说：“去吧，外面有什么风声，速来报我，如有差池，小心你的脑袋！”小喇嘛把小嘴儿一噘，哭丧着脸应了一声，走出来了。费扬古悄悄跟定小喇嘛，走到偏僻黑暗处，利落地抓住了他，将刀背卡在他的脖颈上，厉声轻喝：“不许吱声！”就把小喇嘛像提小鸡儿似的，拎到后院西北角的墙角旮旯处，逼问说：“说实话，为什么一人喝茶，要送两个茶杯？那个人是谁？”
小喇嘛吓得哆哆嗦嗦的，半天说不出话来。这时，天上一道流星晃过，借着这道闪烁的星光，小喇嘛忽然认出来，这位拿刀的人，原来就是白天跟在皇上身边的大将军。他又惊又喜地说：“将军请放手，我告诉您是怎么回事。刚才坐在东配殿里的虽然只有一个人，其实殿东夹壁墙里，还有一个人！”
“谁？”
“是俄人派来的刺客！”
“刺客？他要刺杀什么人？”
“要杀皇帝！”听到这里，费扬古大吃一惊。小喇嘛急忙又说道：“实话告诉将军吧，我们寺的大喇嘛，是噶尔丹的养的一条狗，名叫突米契列儿。三天前，噶尔丹率兵来到天山寺，杀死了我师傅，留下这两个贼人，一明一暗，明的冒充大喇嘛，暗的藏在夹壁墙中，单等夜静更深，杀死皇上，举火为号，引来噶尔丹伏兵，将清军一举歼灭。将军如能杀死贼人，为我师傅报仇，全寺的喇嘛都会感恩不尽啊！”费扬古见小喇嘛眼中闪着泪花，言词恳切，便知他说的是真话。嘱咐他不要惊慌，以免打草惊蛇。
扬古不动声色地回到正殿，伺候康熙回西殿安睡。康熙就寝前，费扬古高声说道：“万岁爷早点歇着吧，奴才也睡觉去了。”说罢，用脚跺踏了几下地，制造了自己已走的假相。随后一转身，藏在了康熙睡榻后。康熙自己也当他真的走了，也并没在意，灭了灯，睡了。大约到了三更时分，只听“咯吱”一声，西殿东墙上倏地开了一道暗门，一个黑影从暗门中跳了出来，悄悄逼近康熙榻前。费扬古见那黑影跟前带着一道寒光，知是凶器，“嗖”地一下从榻后跃出，手起刀落，黑影还未醒过味来早已人头落地。屋中的惨叫声，早惊动了门口的侍卫，康熙也被惊醒了，举灯看时，被费扬古杀死的刺客果真是个黄头发蓝眼睛的大个子俄人。
