在戚继光编练的部队当中，有一个很值得注意的记录：
杂流匠役每一营，火药线匠一名，木匠一名，铁匠一名，大铳手三名，各带全副器具.每把总，孛罗一名，喇叭一名，号笛一名，鼓四名，锣手一名，摔钹一名.中军台上下营吹鼓手共三十八名，医士二名，医兽一名，精占筮者验留，裁缝二名，弓匠二名，箭匠五名，火药匠十名，大铳手一队三十名.—，旗帜每伍小旗一面，各随方色.每队中旗一面.每哨官蓝旗一面，门旗三面.每总蓝旗四面，五方旗五面，高招五方五面，每杆灯一个.中军五方旗三副，五方招十面，蓝旗一十二面，门旗一十面，背上小招督战军令旗十二面，清道旗二面，金鼓二面.赏号官二员，坐纛一面.—，夜营应备中军大将旗鼓，上各黄油纸，铁丝灯一盏，俱粗四寸，长一尺五寸;五方旗十面，十盏.吹鼓手三十八名，三十八盏;角旗八面，八盏;将纛一面，上灯四盏.凡各杂流
官生人等每起头目，各带灯一盏，粗同，但长止用六寸，低执，随身.前总哨旗上红油纸，铁丝灯一个，高招一个，俱圆一尺五寸;每一队旗上一个，色同，圆八寸.左总同前总数，但用蓝油纸，长二尺，粗五寸.队灯长一尺，粗同.右总同前总数，但用白油纸，方形，一尺二寸.队灯八寸.后总同前总数，但用黑油纸，匾形，高一尺二寸，横二尺，匾四寸.队灯高八寸，横一尺六寸，匾四寸.
中总塘报等灯俱圆而黄小，止用八寸.—，凡各每灯一盏，用黑油布四层罩盖一个，以备一时遮隐，使寸明不露，或明营暗徙，或暗营倏明，为莫测之巧也.
其中，“杂流匠役每一营，火药线匠一名，木匠一名，铁匠一名”，则是说明了戚继光麾下的火器部队，需要配备相应的人员才能维持其作战的效率。
当然，木匠跟铁匠不一定是为火药部队工作的，但是毫无疑问，火药线匠成为必须的人员，则是说明了戚继光麾下的官兵人员，其火器使用程度很高，引线什么的消耗速度很快，必须要找专门的人员来生产。
这可以说是戚继光经过战争的实际总结之一。
……
《纪效新书》当中，有对地方卫所军进行严厉整编的情况，尤其是单独列出一卷《临阵连坐军法篇》，则可以说明戚继光认为当其时的明军地方卫所军，到了不得不整顿的地步。
《临阵连坐军法篇》：
“旗鼓既习，斯谓之名，一众人之目矣，而心则未也，于是申之以连坐赏罚以威其心，故军法篇为第三。”
凡临阵的好汉，只有数人，每斩获首级，常是数十百人丛来报功，再不想你一起人退来报功，使众兵相望误认是败走，大家都走了.况一个贼首，数十人报功，若斩数十贼首，就该数百人来报，不知这一阵上能有几个数百人，反是自误了性命.此临阵第一禁约.今后其长牌，长枪，狼筅，凡该当先，长兵之数决不许带解首刀，只管当先杀去，不许立定顾恋首级.其杀倒之贼，许各队短兵砍首，每一颗止许一人就提在阵后，待杀完收兵，有令催验，方许离阵赴验.其谁当先，谁有分，谁无分，俱听当先队长对众从公报审.敢有因其恩仇报不公者，军法.每颗首级以三十两论之，当先牌枪筅分二十两，砍首兵二两，余兵无分者分一两，火兵虽不上阵，本队有功，亦分五钱;每颗本队鸟铳手亦分二两.
凡战间贼遗财宝，金银，布帛，器械之类，此诱我兵争财，彼得乘机冲杀，往往坠此套中.今后临阵，遇有财帛，每队止留队中一人收拾看守，待贼平，照队收拾之，多寡各给本队兵均分，百哨队长加一倍，必不许他官克留及后进次到队伍仍留人浑赖.此正是贼当穷败之际，各兵照常奋勇前进，务要加力百倍，庶贼可灭.如违令图财，致兵陷没，或贼冲突得脱，抢财物之兵不分首从，总哨官俱以军法斩.
凡临阵退缩，许甲长割兵耳，队长割甲长耳，哨官哨长割队长耳，把总割哨官哨长耳.回兵，查无耳者，斩.若各故纵，明视退缩，不肯割耳者，罪坐不肯割耳之人，退缩之犯不究.
凡伏兵，遇贼不起及起早者，领伏兵队长通斩，各兵扣工食给恤，仍通捆打.如正兵见奇兵，伏兵已起，不即回应者，同例.
凡每甲，一人当先，八人不救，致令阵亡者，八人俱斩.阵亡一人，即斩获真贼一级，八人免罪;亡一得二，八人通赏.哨队照例.
凡当先者，一甲被围，二甲不救;一队被围，本哨各队不救;一哨被围，别哨不救，致令陷失者，俱军法斩其哨队甲长.
凡阵亡一人，本甲无贼级者，各扣工食一月，给亡者之家优恤，失队者扣一队，失哨长扣一哨，失官扣一枝.但系亡者属下头目仍斩获，功如其所失，通免究，亦不扣工食.亡兵亡官，官为给银优恤.
凡一人对敌先退，斩其甲长.若甲长不退而兵退，阵亡，甲长从厚优恤，馀兵斩首.若甲长退走，或各甲俱退走，斩其队长.若队长不退而甲下并兵退走，致队长阵亡者，厚恤其队长之家，本队兵各扣工食二个月，给亡队长家领用，队下甲长俱斩.若一哨下各队长兵俱退走者，斩其哨长.如哨长不走，致被阵亡，而队兵弃之退走者，斩其各队长，兵通罚工食二月，恤哨长之家.若一哨官之兵与哨官俱退走，斩其哨官.如哨官不走而哨长以下甲兵退走，斩其各哨长，通罚工食，给恤哨官之家.由是而上，至把总，领兵将领等官，皆照此一体连坐行之.凡所谓罚工食者，仍以军法捆打，不死，而又罚其工食，非止于罚工食而免也.
凡所谓恤其家者，不止于罚兵工食以恤之，仍有题奏荫子世袭之恤也.
凡若大阵败走，被贼杀死，官兵伤在背后者，还以败事论，并不优恤，仍罪其各家并原募之人.
凡器械借代，顽钝欠利，私擅更易军装器械，入场忘带一件以上者，军法捆打，照临阵事例，伍队长总哨官连坐.
凡行列不齐，行走错乱，擅离队伍，点鼓不行，闻金不止，按旗不伏，举旗不兴，开旗不接，得令不传，传令不明，道路挤塞，言语喧哗者，俱治军法.
凡临战，布阵已定，移足回头，行伍挤拶，稀密不均，俱斩其哨官长牌手并所犯.
凡不拘昼夜，但系中军起火铳，炮齐起，即是忽然警急，各官兵不必待候常令，即各自扎营，遇敌即战，不必取禀中军号令.
凡差探贼塘报及官兵有闻贼中消息，不拘要紧不要紧，不许官兵於中途邀截问答，径自闭口，速赴主将陈说之后，许宣於众者，方可与把总等官说.若未见主将之先，敢於中途因人问起，即便说出，但有一人先知在主将之前，定以泄漏军机，问者，答者皆坐军法.就是本管的把总哨伙伴问，也不许对他说.又或有已经禀知主将之后，蒙分付不许传说者，到底不许再泄，敢有以强固行要问者，许原人禀来，一体重治.
凡遇贼，各队严备听令，候探知贼人多寡，以凭发兵，不许违令争先，恐陷不测.
凡临阵抛弃军器者，及不冲锋官兵临战易换军士精利器械马匹者，各以军法从事.
凡临阵诈称疾病，畏避艰险者，及故将军器毁折，以图躲避者，斩.
……
从这一卷的内容可以看到，明军当其时的军纪松弛到怎么样一个地步，当然这一个情况也跟明朝的政局变化有很大的关系。
在明孝宗以及明武宗两朝，明军的军队战斗力有部分的回升。但是在明武宗死后，嘉靖皇帝继位之后，明朝的政局开始变得混乱，甚至是连皇帝都在很长一段时间内不处理国家政务，而是追求修道是有必然性的关系。
有人认为明朝中期的国力衰退，起源于明武宗，但是明武宗好歹知道做正事，总比嘉靖皇帝在即位之初就不理国政，而是发起毫无实际用处的大朝仪，为他老爹兴献王争一个名分而不顾国政好得多。
至于明朝中期的军队混乱到什么一个地步，这一点可以从《纪效新书》第四卷《禁令篇》的内容可见一斑。
“号令既繁，人无所措，故复分此别卷，其可以少从缓也，以次旗鼓号令之馀，故以禁令篇为第四。”
凡军中要紧的第一件，只是不许喧哗说话.凡欲动止进退，自有旗帜金鼓.若无令许说话，但开口者，都要著实重处;夜间尤是切禁，千万千万.
凡兵逃走，同队之人各捆打，分一半监固，分一半保拿.如不获，各监一年，通扣工食，另募.
凡征住地方，每队十二人务在一家安歇，时刻不许相离，别生事端，互相觉察.若一家难容，即分对门或间壁，不许搀隔.如不随本队住者，队长与各兵以军法治之.一哨在一街，一营在一隅，各营不许相混，各哨不许相混，各队不许相混.及行营，搀越前后，非令先行先歇，途中下路，一体连坐哨队长.若解手，许同队一人立在道旁候，毕，催上，不许过二里.
凡立成营盘，即是人家墙垣屋舍一般，若人家不谨门户，及容人墙上扒走的事，有也没有但向营出入者，不拘何官何人，定要由门，奉号令，方准放出照入，决容不得各处搀进搀出.如行路时，决不容别人兵马闲人穿路与同路混行.倘是贼般的，却不被诈劫了营盘此一节，又至紧至紧，临贼而故纵者，军法示众.
凡行营，三千人单行二三十里，有事如何传得到？今定约令:凡兵行，不拘从何处起，若有话该报来，务要简明，不过二三句，或往前传，或往后传.自起处，俱队长高声接传，挨传到止处明白，仍传称知道了，再传回原说之人回复.若传到半中途差错，许又传回，云才传的不明白，只传到原传话人再传明白.队长一例接传前去，若传至中途间，而不接传又差错者，挨出军法重治;因而误军机者，军法示众.馀兵并不许开口接助传话，多言者割耳.
凡你们本为立功名报效而集，兵是杀贼的东西，贼是杀百姓的东西，百姓们岂不是要你们的杀贼设使你们果肯杀贼，守军法，不扰害他，如何不奉承你们只是你们到个地方，百姓不过怕贼抢掳，你们也曾抢掳;百姓怕贼焚毁，你们也曾折毁;百姓怕贼杀;你们若争起也曾杀他，他这百姓如何不避，如何不关门锁户？且如去年，我往台州，因是众人家兵难制，沿路百姓固也受害，兵们宿无处，炊无处，又被百姓告来拿著的，挨累官哨队长打死了多少.如今年，我自己的兵，宿有程头，火兵先定歇处，挨次而入，起行依号，扎营点步鼓，挨次而行，经过百姓们闻说到，杀猪牛，贩酒米等待;是个店上，也要留住一日，他有生意，这方是兵民相体的光景.暑行千里，我不曾打一个兵五棍，可不也省了多少打杀两家都有便宜，却不是好也.
凡古人驭军，曾有兵因天雨取民间一笠以遮铠(即甲也)者，亦斩首示众.况砍伐人树株，作践人田产，烧毁人房屋，****作盗，割取亡兵的死头，杀被掳的男子，污被掳的妇人，甚至妄杀平民假充贼级，天理不容，王法不宥者，有犯，决以军法从事抵命.
凡军中，惟有号令，一向都被混帐惯了，是以赏也不感，罚也不畏.我今在军中，再无一句虚言与你说，凡出口就是军令，就说的差了，宁任差误底，决不改还.你们但遇号令金鼓旗幡是听，是看，是怕，不可还指望不便处，又告有改移，或望宽饶.将无还令，此在口之常谈，你们岂不知？
宋时北兵称岳爷军曰:撼山容易，撼他一个军难.只是个畏将法，守号令之验，如此则将也成名，你们也得成功，又保全了性命，多少好处.今后不知学好的，若再平时用好言好语，个个说是勇猛忠义，你就说得活现，决不信你，只是临阵做出来，便见高低.
凡冒名顶替入操者，正替身俱以军法捆打，所雇之人即充兵收操，工食即将原雇之人分支一半.
……
从第四卷的内容来看，明朝当其时的地方卫所军，不仅仅是军令松弛，而且还有扰民严重，甚至是兵匪难分的现象出现。
戚继光也许是知道这算是大明帝国军队的一个整体现象，最终只能够以兵书的方式来传达需要改变的情况。
但是很可惜，《纪效新书》虽然能够流传，但是与戚继光有可能的初衷，是没有什么关系了。
在万历三大征之后，明军地方卫所军，正式成为了一堆中看不中用的花架子。明朝的作战，更多只能够依靠边军来完成，这一点也进一步消耗了明朝本来已经十分虚弱的国力。
