（3）规模效益。它是在合作与不合作之间产生的，合作与不合作相比所节约的交易成本便构成了合作的规模效益，也就是我们所说的1+1>2时大于的那一部分，即合作的边际收益。在长期的计划经济体制下，产学研各方在条块分割的状态下进行了专有资源的积累，使其在各自的领域内具有优势，而进入另一领域时则显示了弱势。通过相互合作给双方带来扬长避短的机会，这种机会给合作体赢得规模效益，即产学研合作各方对资源进行有效配置后产生的边际收益。它所揭示的本质是当合作时的边际交易费用等于边际组织成本（代理成本）时，合作取得最佳规模效益。显然，把握这一均衡点，就使得合作的规模效益最大化。
（4）内部边际收益。交易费用与交易的次数成正比，在没有合作之前，产学研各方以单一企业的形式独自交易，必然使交易次数增加，导致交易成本增加。通过合作，成立一个新的合作体进行对外交易，从总体上就会减少交易次数，降低交易成本。同时，随着合作体的形成，合作成员也增加了，就会增加新的合作体内部的代理成本，弱化合作的预期效果。由此可知，维系合作体的存在与发展的内部动力还在于其他条件不变的情况下，产学研各方内部化以后的合作体降低的交易成本至少要等于合作体内部新增代理成本，即企业在内部组织一笔额外交易的边际收益与其边际成本相等时，合作才会发生和延续。
（5）非物质利益。大学、科研院所在追求物质利益的同时，还追求学术水平的提高、人才的培养、社会地位和名誉的提升、心理满足等非物质利益，也构成合作的内在动力。五、利益分配机制
为了使高校、科研院所和企业达到良好的联合，通过法律、法规、制度、合同、协议、考核、评估等办法来约束各方的合作行为，提高合作的自觉性，维护各方的共同利益。在合作、实践过程中要制定规则，建立和完善合作制度，明确合作宗旨、联合原则、职责义务和实施细则，健全组织机构，找准产学研联合的热点和结合部位，为建立合作基地和合作的利益分配机制作保证。
利益分配机制是按照公平、客观的原则，科学确定合作各方利益分配情况的具体规则和分配方法。产学研合作利益分配的主要依据是各方对组织贡献的大小，因此，设计或选择科学合理的利益分配机制与方法是组织成立与可持续发展的重要基础。通常在产学研合作建立之初，可以采用各方接受的方法或协商方式，对各方利益分配比例和方法做出清晰、明确的规定，而经过一定时间运行后，再根据各方对组织贡献大小，进一步协商和调整利益分配比例和方法，保证利益分配的公正性与客观性。
在这里，产学研各方应强化法制观念，以法律为合作基准，用合同、协议、章程等来规范自己的行为，建立起协调的合作关系，从而形成良好的利益分配机制。近几年来，产学研联合中的知识产权纠纷屡有发生，已成为影响合作的一大障碍。一些高校、科研院所与企业往往凭“关系”开展合作，法制观念淡薄，一旦出现知识产权纠纷，又怕“打官司”，只好中止合作，大大挫伤了产学研联合的积极性。为了保护知识产权，近年来我国先后颁布了《中华人民共和国科学技术进步法》、《中华人民共和国技术合同法》及其《实施条例》、《促进科学技术成果转化法》、《关于正确处理科技纠纷案件的若干问题的意见》，并推出了《有效保护及实施知识产权的行动计划》。这些法律法规是当前有效保护知识产权和正确处理科技纠纷以及进行利益分配的准则和依据。开展产学研合作，应依法签订合同，明确各方的权利、义务，对违约行为的处理及其违约、赔偿责任要作出详细的说明，对知识产权的归属与利益分配问题应依有关法律作出明确规定；应更新传统观念，由“凭关系”、“靠人情”转向靠法制进行合作，妥善解决知识产权和利益纠纷，促使产学研联合迅速走上规范化、法制化的轨道。以法律为基础，以合同为依据，认真履行合作义务，使产学研联合在制约中健康发展。
六、中国产学研合作运行机制的发展状况
（一）我国产学研合作运行机制的类型
我国经过多年对产学研合作发展的理论研究与实践，初步建立了自己的运行机制，大致可以分为以下几种类型。
单元型合作机制——单元型合作机制是合作各方以单个项目或单项任务的合作需求为纽带，各方只对自身所承担的具体任务负责的一种运行方式。这种机制是我国产学研合作初级阶段的主要方式之一。
股份型合作机制——股份型合作机制是合作各方为实现特定的合作目标，通过对各方（包括主创人员和主要经营者个人）所提供资产作价人股，建立起的一种以资本运营为纽带的股份合作机制。
跨越型合作机制——跨越型合作机制是为实现特定的合作目标，产学研合作的任意一方按照市场机制，通过改制、转制或重组等形式，整建制或部分建制进入另一合作方，并与其组成一种新的技术经济实体的合作机制。
（二）我国产学研合作运行机制面临的问题
1．高校运行机制问题
首先，高校存在观念上的错位。一些高校没有很好解决“面向”的问题，一些陈规陋习至今仍在人们思想上占据着重要的地位，这种封闭式的、传统式的办学观念就是当前实行产学研合作的最大障碍之一。一些高校还存在着小生产者思想，追求自我完善，自成体系，把着力点放在争取重点学科数量以及硕士、博士数量上，缺乏市场观念和商品竞争意识。其次是缺乏相应的管理机制。一些高校原有的科技管理体制和运行机制，已经不能适应社会主义市场经济体制的需要。再次是一些高校没有形成有效的科技成果推广体系，没有专门从事技术开发和推广的队伍。科技成果商品化往往要经历由研制到成果和由制成品到形成产业两个阶段，而一些高校由于缺乏现代企业经营管理人才，科研人员缺乏生产经营领域中需要的知识和技能，这不利于科技成果商品化，不利于产学研结合的实施。
2．企业运行机制问题
首先，企业追求技术进步意识和风险意识较差。一些企业只依靠简单扩大再生产的办法来获得生存和发展，不愿承担开发新产品、采用新技术的风险，缺乏依靠科学技术和培养人才来扩大再生产的积极性。对高校的科研成果只要求短、平、快项目，而不愿意接受技术水平高、转化周期较长的成果。其次是成果处理简单化。企业引入科技成果以后，不愿再进行二次开发，只是对成果进行表面使用，而不进行成果的后续性开发，没有实现科技成果本身具有的潜在价值，间接造成成果使用浪费。
3．政府协调机制的问题
首先，产学研合作缺乏各级政府部门、产业管理部门的紧密配合和有效管理。科技计划与经济计划不协调、科技与经济相脱节的矛盾，现阶段还没有得到很好的解决。高校的科技成果、技术创新活动难以纳入各级政府部门的计划，使产学研合作仍处于推动与引导层面。有关部门没有依据政府的政策法规进行有效的引导、协调、控制，在利益分配、成果分享上管理不健全，影响了合作的积极性。其次，高校与企业分属两个管理系统，协调配合程度不够，目标与实践往往有不一致现象，阻碍了产学研合作的良性循环。
（三）我国产学研合作运行机制的优化
1．建立健全产学研合作的激励机制
产学研合作的激励是指对产、学、研合作各方加以激励，使他们通过分工和交易，客观地为全社会的科技进步而工作，从而实现自利与互利、局部利益与社会整体利益相互统一，达到最大利益与总目标的一致。产学研三方各自的追求不相同：高校以追求社会效益最大化，提高教学科研水平为根本目的；企业则追求经济利益的极大化；从事公益性研究的国有科研院所则以多立项以争取国家项目拨款，并多承接企业项目，从而争取额外利益为目的，其中已转制实行企业化管理的科研院所则既追求科研水平的提高，同时也追求实现利益的极大化。虽然这种利益追求从表面上看往往具有短期、局部的特点，但由于产学研合作不断使技术合作向专业化方向发展，其各自的利益也通过各种不同形式的合作和调整而得到综合表现，从而凸现产学研合作带来的合作收益。
2．建立健全企业科技管理机制
目前，我国大多数企业技术开发机构的一切经费、技术开发人员和设备主要由企业分配，研究的课题主要取决于企业生产的需要，科技成果也是主要归企业所有。这种机构缺乏自主权，在企业技术创新中没有得到有效的发挥。事实证明，只有扩大企业技术开发机构的自主权，建立自主经营机制，以部分产权来激励技术开发机构及其人员，才能真正增强企业技术创新的活力，促进企业与高校、科研院所积极开展合作。对企业技术开发人员的利益分配要建立多方面、多层次的奖励机制，建立符合我国国情的有效的科技奖励制度，切实提高科技人员的地位和待遇。企业应加大对技术开发人员的奖励力度，除了国家规定的创造发明奖、科技进步奖、星火奖等以外，对在产学研合作中做出突出贡献的科技人员应实行特殊政策，如采取与开发项目的经济效益挂钩、销售利润提成、技术人股、项目经营承包等等一些方式来加强激励。
3．建立健全高校科技管理机制
高校要拥有一支结构合理、素质较高、相对稳定的科技和产业队伍，这是产学研长期合作、稳定开展的重要条件。这就需要高校加大对科研组织机构的改革，建立新的人才机制。首先是内部实行人员分流，鼓舞和支持高校内部教学、科研人员投身于研发、成果推广工作，加快高校科技成果的转化，为企业技术进步做出贡献；其次是高校根据自身的实际情况制定相应的政策，从别的院校、社会或者国外吸引具有开发能力的人才，实行合理的人才分流。这样既可以弥补自身的不足，也可以优势互补，最终形成对企业和高校有利的新局面。为了稳定和发展高校的科技开发、成果推广队伍，高校可以在职称、工资、福利等方面制定相应的倾斜政策。对于高校中从事研发和推广业务的骨干教师，可以在评定和晋升专业技术职务时单列指标，专设专家组。对于需要转岗的教师，也可保留原来的职称和待遇。另外，对于在产学研合作中有突出贡献的人员，可以予以形式多样的奖励并与其利益分配挂钩。高校的科研工作从科研选题到研制以至成果的开发、推广与采用，都要紧密地结合市场，而且在组织管理上也要面向市场。高校要加强产学研合作工作的组织和领导，成立专门的领导和工作机构，定期讨论和协调与合作有关的问题。
4．建立健全社会协调机制
在我国，科技立法和教育立法才刚刚起步，很多方面还不够完善，并且缺乏关于产学研合作的专门法律法规。究其原因，一方面是本身就不健全，另一方面是有法不依和执法不严。当前需要加强两方面的工作，一是要加强对现存的法律法规进行清理，根据实际情况加以分析研究，将不配套的条款加以调整，对操作性差、实施途径和措施不明确的加以修改；二是要建立一系列切实可行的促进和规范产学研合作的法律法规，同时加大法律的宣传力度，加强发展观念，同时做好法制监督工作。政府在产学研合作中的管理作用，主要体现为政府运用经济手段、计划手段以及制定技术政策与调整产业政策等手段来刺激和引导产学研合作的发展。其中经济手段主要包括运用税收、财政补贴、信贷、价格等手段来行使政府的宏观管理。建议国家制定一些优惠政策来促进产学研合作的发展。如在税收上，建议合作项目应享受优惠的税收待遇，对产学研联合体企业实行税前分利、各自纳税的办法，对高校参与企业技术改造和成果转化的课题适当采取倾斜的政策等等，通过政策来引导企业加强与高校的科研合作。另外，资金短缺是制约企业技术进步、高校成果转化以及产学研合作开展的关键因素之一，要形成多方位、多层次、多渠道的融资方式，来促进产学研的发展。
