1938年新年伊始，《新华日报》、《解放》等报刊刊出文章，公开说陈独秀是"托匪汉奸、日寇侦探"。
面对王明、康生之流的无端诬蔑，陈独秀听从了周恩来托人带来的规劝，没有公开辩驳。陈独秀后来对他的学生分说："王明、康生向来不择手段，不顾一切事实是非，只要跟着他们被牵着鼻子走，便是战士，不听话的便是汉奸，做人的道德应该是这样的吗？"
这时的陈独秀已没了当年的冲天霸气，但他一贯的精神独立和忠节已经是他身体上挠不掉的一块疤了。对于重庆蒋介石的高官相诱，他一口拒绝："现在蒋抗日，我不反对他就是了，他杀了我两个儿子和那么多同志，我与蒋介石不共戴天！"。对张国焘请求他在共产党与国民党之间再组织一个政党，他更是反唇相讥："难道我们比毛泽东和蒋介石还高明？"
五
1942年5月27日，陈独秀在四川省江津县鹤山坪的居舍里凄然过世。
妻子潘兰珍一直陪伴在他的身边。这个小他二十多岁的中年女子，是陈独秀的第三任妻子。这位相貌清秀的上海女工，在陈独秀上海被捕之前，虽然与夫君每天睡在一张床上，但她竟不知自己的丈夫就是大名鼎鼎的陈独秀。在此之前，陈独秀的结发妻子是由家庭包办的，新娘叫高晓岚，当时二十岁，比他大三岁，是清军安庆营统领家的闺秀。第二个妻子叫高君曼，是高晓岚的同父异母妹妹，小陈独秀十岁，在北京女子师范学校读过书。在高晓岚、高君曼、潘兰珍三个女人之间，陈独秀在当总书记时还曾与一位叫施芝英的医生秘密同居。正是因为陈独秀与姨妹的私奔、与女医生的私通、以及逛窑子这些难免使人生出腹诽的生活历史，让人们对他在生活方面的为人颇有微辞。
回头看这一历史，不难看出，陈独秀的才情和秉性，注定他只能是一个政党的发起者、组织者，但他没有能力领导党走向成就的顶峰。陈独秀就像站在航船上的稻草人，似乎那么的挑衅和顽强，但是他充其量不过是借箭的靶子，然而，人们就是用从陈独秀身上拔下来的箭攻破了敌人的城郭。在众人从他身上抽出箭来的同时，陈独秀也散了架。
陈独秀、李大钊、李立三、博古、毛泽东、刘少奇、邓小平、胡耀邦这一个个在中国发展进程中凸现的领袖人物，就像世界发展温度计上的一个个刻度，或见证低谷，或见证峰巅。研究中国革命和建设的历史，需要拿出勇气公正客观的评价包括像陈独秀这样有功过是非的领袖人物。今天，北京重修陈独秀故居，就是对历史的尊重。
临走的时候，孙志诚老人说，没有比当今更好的时代了。
