2015年7月某一个小区一个17岁的男孩在坐在电脑前一边悠闲的喝着可乐，一边在全神贯注的玩着电脑游戏，这是这个男孩悠悠的叹了一口气说道：“要是我能到神奇宝贝的世界该有多好呀！这个就是我们的主人公阿虎，一个超级的神奇宝贝迷，没想到他的这一句感叹居然能够梦想成真。当他正沉溺在幻想中的时候他的电脑突然冒起了火，阿虎先是一惊然后他跑到洗手间打了一盘子水朝他的电脑泼了过去，没想到他这一泼火势没有丝毫减弱的迹象反而有点大了，这是只听砰的一声，电脑炸了，由于阿虎离电脑太近了，阿虎也受了伤昏迷了过去。
当阿虎再醒来的时候他发现自己并没有在医院里而是在一个他陌生的环境里，里面的摆设显得有点凌乱，这是他听见窗外有不知名的鸟叫声，出于好奇他做到窗户面前看了起来，当他看到窗外面的世界时完全被惊呆了，阿虎还使劲的揉了揉眼，还朝自己的大腿使劲的掐了一下，感觉到了疼痛以后，阿虎才确定在他眼前所呈现的一切是真实的。窗外的天空中有不少的波波再飞行着，还有一些类似拉达一样的神奇宝贝在地上奔跑着。这是房门突然打开了一个身穿白大褂的老年人走了进来，阿虎一看那老人顿时惊呆了，这个老人不是别人正是大名鼎鼎的大木博士，大木博士见到阿虎后说道：”阿虎，你终于醒过来了，爷爷都担心死了。“爷爷，阿虎一听大木博士居然是自己的爷爷，顿时有点蒙了，难道自己是小茂，不可能小茂是褐色的头发而自己确是黑色，自己不可能是小茂，正当阿虎使劲的回忆的时候，阿虎感觉到自己的头有一点疼接着一波好似潮水的记忆向自己的脑海里涌来，通过解读这些记忆阿虎对于自己的身份有了一个初步的了解自己的名字和前世一样都叫阿虎，而自己的父亲则是大木博士的长子，目前在联盟里担任教官的职务，而自己的叔叔也就是小茂的父亲，子承父业现在也是一位神奇宝贝研究人员目前也在联盟工作。至于自己为什么会躺在床上，是因为这个阿虎为了观察神奇宝贝的习性误入了大针蜂的领地从而被大针蜂给扎伤的，因为联盟有规定只有十岁以上的孩子才有使用神奇宝贝的权利，而现在的阿虎只有8岁，所以没办法使用神奇宝贝，所以才吃了大亏。
大木博士见阿虎的情况也有所好转了，说道：“阿虎你好好的休息一下，下个星期小茂就会来到我这里。话说我那两个兔崽子儿子也真是的，他们忙以为他老子我也不忙吗？把你们放在我这里。说到这里大木博士好像想到了什么。”连忙跑到了厨房里去了，边跑还边说我的拉面呀！留下是满脸黑线的阿虎，阿虎心想大木博士原来是那么的幽默，比动画里更有亲近力。经过一个星期的休养阿虎也都恢复好了，与此同时小茂也来了，通过记忆阿虎也了解到小茂其实和他也是谁也不服谁，小茂不服阿虎的原因听起来也有一点可笑那就是因为阿虎比小茂早出生了几天，小茂得叫他哥哥而已。因此小茂从来也没有叫过阿虎哥哥，阿虎也从来不在乎。自从小茂来了以后阿虎除了吃饭的时候和小茂见过外，其余的时间几乎见不着也不是阿虎故意躲着小茂，是因为阿虎吃完饭以后就钻进大木博士的书房里研究着关于神奇宝贝的各种知识，而小茂整天出去疯玩。阿虎发现现在的神奇宝贝对于伊布的进化类型只停留在火、水、雷这三种类型里，非常的不全面。阿虎于是结合前世的记忆把伊布的各种进化类型以及进化方法做了一个总结交给了大木博士，大木博士看了以后非常的吃惊，但是也发现了一些不足，在大木博士修饰一下后，大木博士以阿虎的名义发表了出去，文章一发表顿时引起了轩然大波。一些神奇宝贝的训练家通过阿虎的办法居然培育出来除火、水、雷其他的伊布进化型，这也使得阿虎成为了神奇宝贝研究界的一颗耀眼的新星，阿虎知道他自己的目标不是一名神奇宝贝科学家，而是一名训练家。阿虎现在所做的一切不过是为了成为一名训练家所做的准备而已。
转眼间阿虎已经10岁了，到了可以出门旅行的年龄了，阿虎在这两年之间又写了不少的文章，一经发表都引起研究界的轩然大波，其中最有名的几篇分别是《胡说树的属性归属》在这篇报告中阿虎把胡说树划分成岩石类，还有《笨笨鱼的进化》阿虎通过提高美丽度来提高进化的成功率，芳缘地区的训练家通过阿虎的方法果然使笨笨鱼成功进化，正因为阿虎的表现所以阿虎被视为大木博士的接班人，并且被人称为小大木博士。
明天就是阿虎外出旅行的时候了，但是今年的情况有点特殊，达到要求的孩子一共有五个，而神奇宝贝却有四只，而且大木博士告诉这四只神奇宝贝中没有一只是阿虎的，阿虎问大木博士为什么大木博士告诉阿虎说：“联盟为了表扬阿虎近几年来的成就会奖给阿虎一只神奇宝贝，明天就会传送过来。”阿虎听完以后就放心了，心想：”联盟的奖励的神奇宝贝一定不会是那种大街货吧！那未免太小气了吧，说不定会是迷你龙。“阿虎越想越兴奋。
