登陆注册
15420500000025

第25章 原子键电负性均衡浮动电荷力场的应用(7)

在这一部分,我们讨论几个动力学性质:离子的扩散系数、离子的迁移率、离子第一水合层水分子的停留时间、离子在连续时间间隔tn和tn+1的速度矢量的夹角,以及氧氢键的振动频率。利用均方位移和速度自相关函数来获得离子的扩散系数DI。通过离子扩散系数DI,根据爱因斯坦相关方程uI=DIqI/kBT(其中,kB是Boltzman常数,T是绝对温度,qI是离子的部分电荷),我们可以确定离子的迁移率uI。这些动力学性质(Fe2+和Fe3+离子扩散系数和离子迁移率没列在表中),以及实验和其它的模拟结果[193,200,242]列在表8-11中。从表中可以看出,二价的碱土金属离子的扩散系数小于单价的碱金属离子的扩散系数,这是因为碱土金属离子较大的电荷密度和较小的离子半径使得它们周围的水分子牢牢地束缚在离子周围,在运动过程中以一个非常牢固的水合离子的形式移动。利用均方位移(MSD)和速度自相关函数(VAC)计算的Fe2+离子的扩散系数为0.69(MSD)和0.50(VAC),Fe3+离子的扩散系数为0.50(MSD)和0.46(VAC),这与实验测得的Fe2+和Fe3+离子的扩散系数(Fe2+离子:0.64、0.70,Fe3+离子:0.53、0.55、0.68)有很好的符合。总体上,浮动电荷模型能很好地产生实验测得的离子扩散系数和离子迁移率,而且实验得到的离子迁移率随离子半径的变化规律也被我们模型所预测,因而可以说,浮动电荷模型优越于固定电荷模型。注意:qI来自于模拟中的金属离子的电荷,而其它固定电荷模型采用固定的金属离子电荷。

表8-11金属离子在水中的扩散系数和离子迁移率除了离子的扩散系数和离子迁移率之外,金属离子水溶液还包括很多有趣的动力学性质,如第一水合层水分子在离子周围的驻留时间就是另一重要性质。在Li+、Na+和K+的水溶液中,计算的离子第一水合层水分子的驻留时间分别为47.0、28.5和16.6ps。从锂离子水溶液到钾离子水溶液,水分子驻留时间的减少表明离子的第一水合层水分子和离子的第二水合层水分子的交换频率增加,同时也证明了离子-水分子相互作用的减弱。根据第一水合层水分子的驻留时间长短,我们可以理解:小半径的离子(如锂离子)在水中具有低的迁移率。实验quasi-elasticneutronscatting(QENS)测得锂离子第一水合层水分子的平均停留时间小于100ps,其它的模拟给出25~100ps的停留时间。较长的第一水合层水分子的停留时间使得锂离子与第一水合层水分子形成一个整体进行迁移,降低了锂离子迁移率。在二价的碱土金属离子(Be2+、Mg2+和Ca2+)和过渡金属离子(Fe2+和Fe3+)水溶液的模拟时间范围内,我们没有观察到第一水合层水分子的离开,说明这些水分子在高价离子周围具有较长的停留时间。实验确定的Fe2+离子和Fe3+离子与它们的第一水合层水分子的结合时间分别为10-6~10-7秒和10-3~10-5秒,超出我们的模拟时间。我们计算了Fe2+和Fe3+离子的第二水合层水分子的停留时间,分别为13.2ps和21.7ps,与其它的模拟结果(如利用SPC+CCL水分子模型模拟Fe2+和Fe3+离子水溶液[217]得到第二水合层水分子的停留时间分别为13.9ps和25.0ps)有很好的一致性。

离子在两个连续时间间隔的速度矢量的夹角,即跳跃角度是分析离子动力学的又一重要的量。单价的碱金属离子Li+、Na+和K+的跳跃角度分别为5.26°、2.07°和1.54°,二价的碱土金属离子Be2+、Mg2+和Ca2+的跳跃角度分别为7.77°、4.61°和2.77°,即二价的碱土金属离子的跳跃角度比单价的碱金属离子的跳跃角度大,且都随着离子半径增大而减小。这种现象可以用经典力学的碰撞理论来分析,小半径的离子周围的水分子在第一水合层具有较长的停留时间,因此离子在迁移的过程中不断地碰撞水分子(水分子阻碍离子的迁移),离子就具有较大的跳跃角度和较小的扩散系数。随着离子半径的增加,离子周围的水分子在第一水合层的停留时间减少,第一水合层水分子对离子迁移的阻碍作用减小,跳跃角度也就减少,相应,离子扩散系数和离子迁移率增大。

8.4.5水分子的振动光谱振动光谱是研究溶液体系的一个重要的信息资源,而且,OH键的伸缩振动是离子水合作用的一个敏感探针。离子水溶液中的离子和水分子中的原子在不停地运动,与这些运动相关的运动模式各有其运动的频率。与原子有关的运动模式的频率可以由速度相关函数的傅立叶(Fourier)转换计算,ω为频率,Re表示取括号中的实部,I(ω)称为该频率的图谱密度(spectradensity)。

根据计算的轨迹将上式转成:

NT为计算的总的步数,为时间间隔。根据各个频率的图谱密度绘出所得的图谱称为功率谱(powerspectrum),由功率谱可以检测各种运动的频率。

根据速度自相关函数的Fourier变换,我们可以获得水的功率谱。图8-18给出了锂离子水溶液的水的振动光谱,其有两个特征峰:1400cm-1处的峰为HOH键角的弯曲振动峰,3500cm-1的峰为OH键的伸缩振动峰。实验上,在室温时,LiCl水溶液[179]

的HOH键角的弯曲振动峰为1654±3cm-1,OH键的伸缩振动峰为3440±5cm-1,我们计算的OH键的伸缩振动频率与实验值有较好的符合。Car-Parrinello模拟锂离子水分子体系得到了与我们相似的水的功率谱。

金属的极化能力不同,对水分子结构的影响也不同,因此我们研究了各个金属离子的第一水合层水分子的氧氢键伸缩振动光谱,并以锂离子水溶液为例分析了锂离子第一水合层水分子和外层水分子的氧氢键伸缩振动光谱的差别,分别列于图8-19和图8-20。图8-19表明锂离子的第一水合层水分子的氧氢键伸缩振动光谱在一定程度上向低频移动(约84波数),而外层的水分子的氧氢键伸缩振动光谱向低波数方向移动程度较小,几乎具有与液态水相同的谱图。如图8-20所示,对比纯水体系(氧氢键伸缩振动频率在3523波数),各个碱金属离子的第一水合层水分子的氧氢键伸缩振动光谱的峰位分别位于3448cm-1〔Li+(aq)〕,3449cm-1〔Na+(aq)〕和3460cm-1〔K+(aq)〕,都有向低频移动的趋势,而且离子极化强度不同,水合层水分子的氧氢键伸缩振动频率向低频移动的程度也不同。各个碱土金属离子第一水合层水分子的OH键伸缩振动光谱也都有一定程度的向低频移动,而且离子极化能力和离子半径的不同,离子周围的水分子的OH键振动光谱向低频移动的大小也不同(随着离子半径的增大和极化能力的减弱,向低频移动的程度较小)。对比碱金属离子的第一水合层水分子,碱土金属离子第一水合层水分子的OH键伸缩振动频率较大程度地向低波数方向移动;对比碱土金属离子和碱金属离子的第一水合层水分子,Fe2+和Fe3+金属离子第一水合层水分子的OH键伸缩振动较大程度地向低频移动,而且离子极化作用和电荷密度不同,向低频移动的大小也不同。从OH键振动频率的谱图可以看出不同金属离子对水分子结构的不同影响。因此,基于ABEEM/MM势能函数能较好地描述各个金属离子水溶液的分子间相互作用以及离子对氧氢键伸缩振动频率的影响。

8.4.6离子水合动力学

一个离子的第一水合层水分子的交换长期以来是一个令人们感兴趣的课题,对于一个六水合金属离子在水中发生的交换反应可以写为:

Mn+(H2O)6+H2O→Mn+(H2O)5(H2O)+H2O(8-22)Langford和Gray[248]指出,水分子可以发生几种交换机制:第一种是缔合交换(associativeexchange)A,一个外层的水分子先加入到水合离子化合物中,这样金属离子就多了一个水分子,接着化合物中的一个水分子离开;第二种是解离交换(dissociativeexchange)D,在外层的一个水分子进入水合离子化合物之前,化合物中的一个水分子先离开;第三种是相互交换(interexchange)I,在同一时间里,进来的水分子与离开的水分子发生交换;第四种是缔合相互交换(associativeinterexchange)Ia;第五种是解离相互交换(dissociativeinterexchange)Id,这五种交换类型展示在图8-21中。Langford和Gray[325]提出的水交换图解与Basolo和Pearson规则[326](基于Hughes-Ingold规则[327],用于有机取代反应研究)相联系:A机制对应SN2(lim)反应,Ia机制对应SN2反应,D机制对应SN1(lim)反应,Id机制对应SN1反应。

图8-21五种交换过程各种实验和理论方法对水的交换机制已经进行了较详细的探讨和研究,本文则用ABEEM/MM-MD模拟来对碱金属离子(Li+、Na+和K+)水溶液中离子的第一水合层水分子的交换作一点探究。在这部分,我们检查几个离子第一水合层水分子的交换事件。首先,交换的速率常数kMD/,其中,是离子第一水合层水分子的停留时间。交换的速率常数还可以表达为kMDTST,其中,kTST是过渡态理论(TST)的速率常数,是转换系数。对于离子水分子体系,自由能或平均力势可以不用很长时间的自由能差模拟来计算,而通过径向分布函数来确定:

W(r)ln(g(r))(8-23)过渡态理论的速率常数kTST可以利用下面式子来确定:

这里,是离子-水分子的约化质量,等于kTB1/,r是活化势垒的位置,W(r)是平均力势,()effWr是有效的平均力势。图8-22给出了不同碱金属离子水溶液中离子-水分子的平均力势和有效的平均力势随着离子-水分子距离的变化情况。从Li+(aq)到K+(aq),解离的势垒从5.9kBT变化到2.2kBT。

我们计算的水交换的速率常数kMD,过渡态理论的速率常数kTST和转换系数

值列在表8-12中,并对比了Koneshan实验组[328]的模拟结果。Rey等利用不同的势能模型对锂离子水溶液和钠离子水溶液进行模拟[329],对于锂离子第一水合层水分子的交换,他们计算得到的转换系数为(0.14±0.02)~0.42;对于钠离子第一水合层水分子的交换,他们获得的转换系数为0.07~0.26。通过对比可以看出,ABEEM/MM-MD模拟能够合理地预测水合层水分子的交换。

表8-12水的交换动力学:

kMD、kTST和值图8-22离子-水分子的平均力势和有效平均力势随着离子-水分子距离的变化曲线为了给出模拟过程中离子水合层结构的振动情况,我们计算了离子-氧的距离随模拟时间的变化关系,展示在图8-23中(E表示进来的水分子,L表示离开的水分子)。在我们的模拟中,锂离子周围水分子的交换主要是缔合型的,钠离子和钾离子周围水分子的交换很复杂。而且,对于不同的离子水溶液,交换的顺式(进来的水分子从离开的水分子同侧进入)和反式(进来的水分子从离开的水分子反面进入)的立体结构也是不同的。图8-23仅给出几个不同交换过程和交换机制的例子:锂离子水溶液对应一种缔合顺式的机制,钠离子水溶液对应一种解离顺式的机制,钾离子水溶液对应一种缔合反式的机制。另外,ABEEM电荷也可以从某种程度上监控水的交换反应,因为在每次交换中,进来的水分子和离开的水分子的各个电荷位上具有明显不同的电荷分布。因此,对比固定电荷模型,浮动电荷模型能够影响水的交换过程,并使得离子水合层结构有很大的振动,这是因为浮动电荷模型能够根据改变的体系结构及时地调节体系的静电场。

8.4.7金属离子水溶液的热力学性质一个可以测得的热力学性质就是离子的溶剂化焓(PRTsolsolsol)。

在298K和常压下,solP和RT值较小可以忽略,这样离子的溶剂化焓sol几乎等于离子的溶剂化能sol。离子的溶剂化能sol可以通过模拟纯溶剂和稀的离子水溶液来获得。在本文中,我们计算了碱金属离子的溶剂化能,即用Li+、Na+和K+离子水溶液的总的势能减去纯溶剂的势能(215个水分子的势能),就得到这些离子在水中的溶剂化能。这些计算的值,以及MonteCarlo模拟结果和两套实验的数据,列在表8-13中。Chandrasekhar等利用MonteCarlo模拟锂离子水溶液和钠离子水溶液,并计算了这两个离子的溶剂化能,但他们高估了锂离子和钠离子在水溶液中的溶剂化能。两套实验数据的最大差值为17.5Kcal/mol,这是因为单个离子的溶剂化能不能被实验直接测得。我们计算的锂离子、钠离子和钾离子在水溶液中的溶剂化能与两套实验数据(离子的溶剂化焓)有很好的一致性。

另一个可以测得的热力学性质就是利用自由能微扰模拟计算得到碱金属离子的溶剂化自由能。ABEEM/MM-MD模拟的结果以及其它力场模型的模拟结果和两套实验的数据都列在表3.9中。两套实验结果的最大差值为14.8Kcal/mol,但两套实验数据给出了几乎一致的钠离子和锂离子溶剂化自由能差以及钾离子和钠离子溶剂化自由能差。我们计算的碱金属离子的溶剂化自由能以及钾离子和钠离子的溶剂化自由能差均与实验值有较好的一致性,略高估计了钠离子和锂离子的溶剂化自由能差。

同类推荐
  • 非读不可的博弈论

    非读不可的博弈论

    《非读不可的博弈论》全面介绍了博弈论的基本内容,对博弈论进行了深入的解读,并将各种复杂的理论还原和转化为通俗易懂的人生智慧,力求启发读者窥见博弈科学的门径,在理论的指导下获取人生的成功。
  • 农村科普知识常识——气象知识

    农村科普知识常识——气象知识

    科学普及简称科普,又称大众科学或者普及科学,是指利用各种传媒以浅显的、让公众易于理解、接受和参与的方式向普通大众介绍自然科学和社会科学知识、推广科学技术的应用、倡导科学方法、传播科学思想、弘扬科学精神的活动。
  • 走近数学(科学新知丛书)

    走近数学(科学新知丛书)

    本书主要讲述的是:从认识数到摘取皇冠明珠的历程、占统治地位两千多年的欧式几何、数学与计算机、国际数学奥林匹克、国际数学奖。
  • 探究式科普丛书-生物的环境:生态学

    探究式科普丛书-生物的环境:生态学

    生物在生存和发展过程中,对周围的空气、光照、水分、热量和无机盐类有着各自不同的要求。而生物之间在长期的演化中,逐渐形成了相互依存、相互竞争的关系。在生态环境中,人是重要的一环。为了满足自身的需要,人类不断地改造环境,环境反过来又影响了人类。这就是生态学。那么,生物和它们生活的环境的关系到底是怎样的呢?人们研究这一关系的目的又是什么呢?读完这本书你会有一个系统的了解。
  • 大中国上下五千年:中国历代科技成就

    大中国上下五千年:中国历代科技成就

    本书分为天文历法、地理探索、水利工程、建筑设计、农学农具、数学成就、物理化学、医学药物、手工制造等多个板块。
热门推荐
  • tfboys之满天星的眼泪

    tfboys之满天星的眼泪

    三个少年,三个少女,再次的重逢,新的认识。再次回想起曾经的往事,或许已不再记得,他们究竟有怎样的结果~~~~美好的未来,靠自己创造,命运把握在自己手里,为它努力去拼搏,去奋斗。
  • 火辣萌狐王爷你走开

    火辣萌狐王爷你走开

    一个什么都会的杀手,在朋友的算计下—重生,然而,重生的身体竟然是一只狐狸!巧救轩王爷,在他的王府住下,杀机不断,你以为我代号S的杀手是吃草的?你有仙兽?很牛逼?信不信哥分分钟让他跪下唱征服?你有绝世丹药?很珍贵?我一般都是当糖豆吃的!啊哈?来一个帅哥表白?抱歉!暝!上!你跟暝一比,弱爆了!
  • 至尊凌天

    至尊凌天

    谁说,高高在上的强者们就是不可跨越的高峰?谁说,默默无闻的小人物就只有选择任人宰割?茫茫前路,未知之途,有佳人相守,恒心陪伴,纵是苍天,捅他一个窟窿又何妨?恶虎在前,豺狼在后,虽万重险阻,千般无奈,且看凌天,怎样把传奇进行到底!
  • 双生星传奇

    双生星传奇

    在浩瀚的宇宙中,有一颗神秘星球,它和地球有着奇妙的共生关系。那里有各式各样的异能,有机甲,有战争。当地球的几位少年可以来回穿越地球和这颗星球,会发生怎样的变化?
  • EXO梦燃

    EXO梦燃

    一个神秘的空间,神、狼、鬼、灵、人五族,一个幼婴,将一切恩恩怨怨紧密联系,仇恨、爱恋,纠结……他是我的狼王,我只臣服于他!——阳佟夏曦不论谁,敢碰你一下,那他就只有死路一条!——吴亦凡我想得到的没有什么得不到,更何况一个女人?——边伯贤你是凡的狼后,我只有守着你的分。——鹿晗乖乖把狼后的位置让出来,不然就等着狼族和神族一样的下场吧!——银灵这一切都是我的罪过,我不希望再有那么多杀戮了!——吴世勋我们神族岂能让他们灭族,灭族之仇一定要报!——金俊勉凡是狼鬼灵三族的,我见一个杀一个。——椒美人
  • 是韩娱啊

    是韩娱啊

    有感而发写的一本韩娱,少时十周年,exid五周年,尽量写好,尽量不太监;嗯,百合向。
  • 宫心计:庶女谋后

    宫心计:庶女谋后

    心心相谋,江山染血,殊死相博,乾坤沉浮。她是苏相府中的二小姐,欲爱不能后便择恨不休,与外人联手,步步为营,势要辜负她的人国破家亡;却不想深陷泥沼,窥视到一角真相,方知原来如此;然而这时,一切已是覆水难收。爱早已在各自的算计中磨灭,恨在各自的憎恨中渐长。他说:“诏月若破,他必拿她殉国。”而这时却又另一人执起她的手,说:“我这一世浮华,锦尘三年,皆是为你而颠,此生我仅想握你之手,感受着浅浅深情。你可知?”是继续碾碎成灰,还是转身拥抱幸福,她亦难以抉择。【情节虚构,请勿模仿】
  • 绝色特工“弱”女子

    绝色特工“弱”女子

    她是弱女子,她是弱女子,她真是一介弱女子啊啊啊啊啊!呜呜呜,为啥大家都不相信她捏?她不过是随便玩玩,结果一不小心把王府玩垮了。她不过是感恩救人,结果一不小心把皇帝报废了。她不过是做个丫鬟,结果一不小心把主子做成暴发户了。她不过是公费旅游,结果一不小心把娃游出来了。
  • 邪王独宠:拐个魔王做夫君

    邪王独宠:拐个魔王做夫君

    现代精英特种兵,意外身亡,一朝穿越成废材,废材就废材吧,她还想过些安逸的日子。可是这个自从第一次见面后就一直缠着她不放的妖孽男人到底想干嘛?她的空间琉璃镯,他轻易的出入,她的房间,他进出自如,她的床,他随身就躺,这是不要脸还是脸皮太厚?“夏浩天,天下女人那么多,你干嘛非要勾引我?”明明被眼前的少女嫌弃,男人嘴角却依旧带着妖孽的笑容,“你被我抱过,被我看过,被我摸过,被我亲过,这些够不够?”【情节虚构,请勿模仿】
  • 观星志

    观星志

    祈壹小福,终行大运。祁小福,父祈久安,母付氏。母亲付氏,为祁家诞下一麟儿,然身子孱弱,又恰逢天灾,终去。父念其母,遂取一谐字——福,而付氏福薄,遂谓之小福。一日,中京来人,告之曰:我等应命而来。问之:何命?答曰:天命。