顺治十八年（公元1661年）三月二十七日，海风顺向台湾，郑成功下令大军开驾，向台湾进发，这是个历史性的时刻。
郑成功的这一举动，虽是为了保存实力企图发展之举，但却也因此成为留芳史册的民族英雄。历史会选择一位英雄去建立伟大的事业，而历史又为实现它提供了条件。
郑军的战舰在海面上排开，旌旗蔽日，战鼓喧腾。400余艘战船满载着25000余名将士向东进发。
但东征的开始并不顺利，大师刚走到柑桔屿，海上便变了风向，郑成功不得不下令收兵回到澎湖（山时）内屿。
此次东征，郑军并没有多带粮食，因为何斌送来情报时说用不了几天就会到达台湾，到了以后粮米就会供应不竭。
何斌原来是郑芝龙的部下，在名义上是一名通事（即翻译），实际上暗中替郑成功管理在台湾的税务，受郑军户官郑泰委派，成为郑成功在台湾的代理人。他暗中给郑成功绘了一张荷兰殖民者在台湾的军事部署图，并探知了一条经鹿耳门到台湾的秘密航道，为郑军攻克台湾做了很大的贡献。后来他替郑成功在台湾收税的事被荷兰殖民者发现，并罚了重金，何斌设计逃出台湾，乘船到厦门到了郑成功军营中。
郑成功为粮食吃紧非常着急，他下令户都事同游击等就澎湖36屿内向百姓派取行粮，以解决急需。各澳长都被调来追取搜寻。但两天过去了，各澳长回禀说，各屿并无田园可种禾粟，只有蕃薯、大麦、黍稷等可供食用，一升一升地从各家凑集，一共才凑了百余石。这还不够大军一顿饭用的。郑成功对粮食吃紧大为紧张，他担心北风无期，长久等待会出问题，便在三十晚传令开船。
这时北风不停，又下起了雨，茫茫海上大雾弥漫。东征台湾本未得到所有将士的同意，此时更多的人对此更加怀疑。郑成功派人抓拿逃跑的军士，送到中军处分。有人劝说郑成功说候风雨后再开驾东征，郑成功以他的果敢帅才坚持东渡。
大军行到三更后，只见云收雾散，天气明朗起来，船队已成为顺风行驶了。
从厦门赴台湾，中间一定要经过柑桔屿，它由东、西二屿组成，中间隔一水，是往来航行的标志。四月初一日黎明，郑成功的坐船已到达台湾的外沙线。这是横亘于台湾外的一道沙线，是在大海上浮起的一道长沙，成为进入台湾难以通过的一道天然防线。郑成功的船只鱼贯进入水域。辰明（早7—9点），郑军已来到鹿耳门线外。
经过探察，船舰大队于午后一齐进入鹿耳门港。这是南北二汕之间的一个港道，水底皆沙，船不易通过。好在何斌已探过这一带的航道，又赶上涨潮时分，郑军才得以顺利地通过。
这天晚上，郑军船队到齐，停泊于禾寮港，并就在此登陆。这样，在不到两个小时的时间里，几千名士兵已经完成了登陆。
自古以来，进入台湾大员湾入口处，有南北两条航道。南航道俗称大港，大船可以自由出入，但完全处于荷兰热兰遮城堡密集炮火的控制之下。北航道俗称鹿耳门，素有天险之称，它是郑成功选择进入台湾核心地区惟一的进出通道，进此通道，便可以直逼荷兰人守备薄弱的普罗文舍堡。鹿耳门是大员湾北端出口处的两个山头，两山对峙，状如鹿耳，故称鹿耳门。
鹿耳门港门狭窄，沙石淤沉，船航迂回，一向只能通小舟。再加上荷兰人事先在这里沉入破船，所以这里没有设防。可荷兰人却万万没想到经溪流和潮汐长时间的冲刷，港内已逐渐形成了一条可以航行大船的港道，这就是何斌向郑军报告的大港道。
当时持有“天险”的荷兰侵犯者头子揆一，站在赤嵌城的城楼上，用望远镜发现郑军居然渡过了“天险”，非常惊讶。他没有想到中国军队会通过“淤浅”的鹿耳门而登陆。
郑成功大军兵临普罗文舍堡的城下，而且切断了它与热兰遮堡（赤嵌城）的联系，使荷兰人连连惊呼：“中国兵真是从天而降，从天而降！”
自此，郑军开始了与荷兰侵略者面对面的战争。
