五代火影千手纲手的办公室内，镜和志村团藏、火影顾问转寝小春、水户门炎在座，五代火影千手纲手说道：“第七班完美的完成了任务，晓组织中的一名成员被砂隐村的千代和小樱联手杀死，蝎临死前告知了一条很重要的信息，蝎和大蛇丸曾经共同联合在一起研究了数项禁术的实验，其中秽土转生得到了很大的突破。”
转寝小春问道：“二代大人的禁术，秽土转生之术？”千手纲手五代火影说道：“由于卡卡西的伤势原因，我已经命令新组建的第七班有大和带领前往草之国的天地桥和蝎安排在大蛇丸身边的间谍会面。”镜说道：“我也去看看吧！”
从“晓”的蝎口中得知其将与派往大蛇丸身边的卧底会面，认为是寻找佐助消息的好时机；在纲手批准下，准备往会面地点——天地桥出发。由于卡卡西在与迪达拉一战中虚耗过多，无法同行，于是由卡卡西的队友原暗部成员、代号大和的天藏担任新队长，率鸣人、小樱及新成员佐井前往目的地。
虽然鸣人及小樱对佐井的假意笑容及毒舌十分反感，但为了佐助，即使要与不喜欢的人合作也心甘情愿。到达天地桥后，大和伪装成蝎，接触卧底，而鸣人们躲在岩后静待指示。令一行人惊讶的是，原来这名卧底就是药师兜。
大蛇丸亦出现，大和的伪装身份被揭穿，双方交战起来。鸣人受到挑衅，妖狐外衣泄露，失去自我意识，误伤小樱。大蛇丸与鸣人爆发激战，被兜称为“怪物间的战斗”。后大蛇丸因三年限期已到，身体不能承受，不敢恋战而去；鸣人亦被大和的木遁所压制，变回人类状态。清醒过后，鸣人得悉是自己伤害了小樱而十分内疚，但同意大和所说，要不断锻炼，用自己的力量去保护身边重要的人。
天地桥一战后，鸣人等人继续追踪大蛇丸一众，却得悉佐井背叛了他们。此时大和的木分身已查出大蛇丸巢穴的所在地，众人决定深入虎穴。他们先找到佐井，将其困绑起来；佐井问鸣人为什麼执著于要拯救佐助，鸣人却说这是因为他与佐助之间，有著兄弟般的“羁绊”。
佐井为其所动，想亲眼看看“羁绊”的意义，终弃暗投明，反过来合力把刚到的兜制服。鸣人与佐井冰释成嫌，组队在大蛇丸巢穴内寻找佐助的下落。不料却又遇上大蛇丸，于是鸣人让佐井先往寻佐助，自己则应付大蛇丸。
樱及大和前来助阵，大蛇丸又再度遁去。鸣人从佐井临走时遗下的秘策中，发现佐井此行目的，原来是要暗杀佐助，不禁再次忧心起来。突然一声巨响，引起鸣人等人的注意，只见现场一片狼藉，佐助正居高临下，冷冷地看着他们。
重遇佐助，鸣人首先是表现兴奋，但佐助冷漠的态度及身手的敏捷却出乎意料之外。佐助称要把鸣人杀掉，以斩断彼此间的“羁绊”；又道出刚才佐井说要替鸣人带他回木叶之事。大蛇丸及兜再次出现，阻止佐助进攻鸣人他们，目的是要留下能铲除“晓”的力量。佐助不再执著，跟著大蛇丸离去。救回佐助的目标再度失败，但却得到了真心的伙伴佐井。
佐助和鸣人再一次交手，过后鸣人带着严重的伤势跟随前来支援的镜慢慢地离开，宇智波佐助被神无名打伤，神无名告知佐助说道：“你很弱小，就像宇智波鼬说的一样，你还没有找打自我，你虽然已经投身恶魔，但是你的心依然纯洁，这样的你始终无法得到你想要的一切，宇智波佐助，你好自为之。”
大蛇丸从药师兜口中得知神无名这名忍者，却对药师兜说道：“依你看神无名最像谁？”药师兜说道：“宇智波止水！”
